港鐵公司提供往返香港與內地的城際客運服務，三條直通車綫分別為北京綫、上海綫及廣東綫。

廣東綫直通車由紅磡往返東莞(常平)、廣州東、佛山及肇慶。目前，來往紅磡與廣州東之間的直通車每日對開十二班，全程約1小時50分鐘，其中十班停靠東莞(常平)站。一班於佛山停站，以肇慶為終站，全程約4小時。

北京綫及上海綫直通車每隔一天開出。由紅磡開往北京西的直通車全程約24小時，開往上海全程約20小時。

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